三棧溪是以三棧南溪為主流，而後在三棧村附近和北溪會合後才出海，注入太平洋。

北溪源於海拔2448公尺的塔山南麓，南溪源於海拔3101公尺的帕托魯山，溪流長約24公里，陡降落差大，地形起伏，在中游切穿山脈，產生了險峻壯觀的峽谷地形，溪谷間奇岩錯綜，雄奇峻秀，有「小太魯閣」的美譽。

三棧溪適合觀察地形、地質、種植物生態，從事健行、攝影、寫生等活動。

深入溪谷旅遊，因為天雨時恐有河水暴漲之虞，所以隨時都得注意自身的安全。